农村信用社和农商行既有区别，也有一定的联系，而且他们是跨行的。
1、性质不同
农村商业银行是股份有限公司区域金融机构，农村信用社是股份合作制企业的地方金融机构。
2、发起人不同
农商行是由辖内农民、农村工商户、企业法人和其他经济组织共同入股组成的股份制的地方性金融机构，目前一般都是由有一定实力的企业发起成立。
而农村信用社是由辖内农民、农村工商户、企业法人和其他经济组织共同入股组成的股份制的地方性金融机构。
3、监管部门不同
商业银行主要受银监会监管，而信用社作为省联社的发起人却主要受省联社监管。
4、管理方式不同
信用社实行社员民主管理,而农村商业银行以股东大会作为最高管理机构。
5、经营模式不同
农村商业银行作为一个整体，以整个银行的盈利为目的，每个分行都会受到总行的直接管理。
而农村信用是在省联的指导下独立运营，每个农信社都是一个独立法人，自负盈亏，省联可以管理和知道信用社的发展，但是不能干涉信用社的业务。
6、服务对象不同
信用社主要为社员提供金融服务,它的服务对象主要是农民，主要服务区域在农村。
而农村商业银行是一种区域性金融机构，它服务的对象比较广，跟其他银行机构是一样的，客户群体可以是农村，也可以是城市，可以使企业也可以是个人。
7、业务范围不同
农村信用社一般主要服务本地，以县级乡镇一级为主，而且信用社之间相互独立，目前各省的信用社是独立的，没有任何关系，相当于各省的农村社是属于独立的金融机构银行。
而农村商业银行除了服务本地市场之外，还会根据市场的需求在外地开设分行，甚至是跨省开设分行。
所以农村信用社和农商行是两个不同的金融主体，他们业务来往是是属于跨行的。
